首先，科属不同

1.黄连:黄连是植物界多年生草本植物，被子植物，双子叶植物，原始铁苋菜属，毛茛科，唐松草属，黄连属，黄连属。

2.岩黄连:岩黄连为植物界、被子植物、双子叶植物、原始花被亚纲、罂粟科、罂粟科多年生草本植物。

第二，形式不同

1.黄连:黄连根茎黄色，常分枝，密被许多须根，叶基笨拙，纸质，卵三角形，三裂，中央裂片卵菱形，羽状深裂，边缘锯齿状，侧裂片不等2分，叶柄长5-12厘米，2-3月开花，4-6月结果。

2.岩黄连:岩黄连高15-40厘米，主根发达。1-3茎，丛生，弱，叶具长柄，叶三角形轮廓，二回羽状分裂，总状花序顶生或对生叶，长7-14厘米，苞片椭圆形至披针形，蒴果圆柱形，稍弯曲，种子多，圆形和杯状种子，覆盖一半种子。

三、功效差异

1.黄连:黄连性寒，味苦，无毒，入心、肝、脾、胆、胃、大肠经。具有清热燥湿、泻火解毒的功效，主要用于治疗湿热饱胀、呕吐、吞酸、泄泻、黄疸、高热头晕、心火亢盛、烦躁不安、血热呕吐、目赤牙痛。

2.岩黄连:岩黄连味苦，性凉，归胃大肠经。具有清热、解毒、利尿、止痛、止血等功效。主要用于治疗肝炎、口舌糜烂、目赤眼松、痢疾、腹泻、腹痛、痔疮、出血。#13;