在第19、20话中，真嗣以百分之400的同步值将使徒击倒，像野兽一样吞噬了使徒的S^2机关，表明了EVA初号机的觉醒。
其中百分之400的真相，是真嗣的肉体以LCL的形式与初号机融合。
而碇源度向SEELE隐藏了这次事件的真相。
因此，在第21话《Nerv、诞生》中，SEELE绑架了冬月，力图从他那里了解碇源度统领下的NERV的真实情况和最终目的。
eva加持到底是怎么死的
参考译文：
加持良治也许是新世纪福音战士中最酷的角色了。他是个“三重”间谍，为NERV的特别检察科和日本内务部调查局工作，同时直属SEELE。他是福音（译注：Evangelion，指这部动画片，下同）中的“詹姆斯•邦德”，他所做的事都很酷，他和最热辣的姑娘（葛诚美里）同床共寝，他总是在搜寻真相。最终，他的行为导致了他的死亡。在第21集中，随着著名的遗言“哟，怎么这么久？”，枪声响起，加持遇害。
对于是谁杀了加持的争论在Eva的Otaku中肆虐了好多年。我们从未见过射击者，也没有听过他们讲话。我们只看到过加持向他们问好（像平时那样若无其事），然后便听到了枪声。
首先我要尝试粉碎任何加持根本没被击中的想法，那是个精致的诡计。这一理论主要在忠实的加持爱好者军团中传播，他们无法相信自己最喜爱的人物遭到射击并被杀死。不算片中所有暗示加持遇害的迹象（美里在电话应答机前哭泣。第22集中电话响起时，明日香认为可能是加持打来的，美里说不可能是他。在重新制作的第24集中真嗣直截了当地告诉明日香加持永远不会再回来了，但明日香说他在撒谎），The End of Evangelion – Theatrical Program——一份官方认可的文档——中直接说明了加持死于枪杀。他死了。但是谁杀了他？谁枪杀了加持？
很多日本观众认为是葛诚美里杀了加持。他们相信，因为美里的房门刚好在枪响后关闭（门牌上写着 M. KATSURAGI ），这一定意味着庵野秀明（福音的导演/创造者）想暗示美里杀了加持。庵野从未打算把这个镜头作为任何种类的线索。事实上，他吃惊地听说爱好者们认为那是美里。他直接声明那不是美里，甚至还编辑了在日本发行的录像制品，用一段街道的镜头代替了美里的房门。他去掉了那个镜头，因为他不想让人们认为凶手是美里！实际上，他对人们认为那是美里感到震惊。对于人们认为他们在实际上根本没有“暗示”的地方找到了“暗示”，他感到为难。也有些人指向第15集中美里威胁要杀掉加持的地方，把它作为证据来证明第21集中美里真的这么做了。但这一观点同样不成立，因为到了第21集（具体显示在第20集的结尾），美里和加持都在做同一件的事：寻找真相。加持死后，揭露“真相”的接力棒便传给了美里。
庵野曾直截了当地说杀加持的人不是美里。官方电影书（译注：Film Book）的“检查点”（译注：Checkpoint）部分也提到枪杀加持的人不是主要人物，是某个来自NERV或SEELE的无名保安人员。
第21集原始的情节中有这样一个场景，一名NERV的保安进入源渡的办公室告诉他冬月曾幸回来了，但他们找不到绑架他的人（这个人当然就是加持）。接下来就是NERV的保安把枪还给美里，并告诉她“事情结束了”，还有他们“不知道‘他’在哪”。似乎很清楚，NERV里没人知道加持在哪。
然而SEELE可能知道。在第20集中，SEELE把加持称作系在源渡脖子上却不响的铃铛。他们说他们会让铃铛响起来。加持为SEELE绑架了冬月，但最后却放了他。重制的第21集中添加了加持和冬月间的对话，冬月警告加持说，如果放了他加持可能会死的。加持回答说“他们”——指SEELE——已经知道加持从他们那偷走Adam（事情发生在第8集）并给了源渡。经过如下：
冬月：
是你。
加持：
好久不见了。
冬月：
这么做你会死的。
加持：
我只是想离真相近一点……我心目中的真相。此外，似乎他们就要搞清我给碇司令偷运Adam样本的事实了。如果我不开始小心点的话，事情可能会很可怕……对我来说。
似乎很清楚，SEELE想除掉加持。至于谁杀了他，嗯，庵野说了不是个主角，只是个保安人员。加持的死没有什么“隐藏的真相”，SEELE派人杀了他，不是什么了不起的方法，他们只是派了一名特工向他开枪。加持带着那为他赢得了众多爱好者的置之度外般的冷静，面对了死亡，就像他一直以来面对生活那样。安息吧，加持良治。
1这个凶手除了杀掉加持再没有任何存在的意义，即凶手是“群众演员”
2剧情中的人物：观点1：葛城美里
支持：加持良治似乎认识凶手；在某个版本中能听出凶手所穿的是高跟鞋或者皮鞋；美里在听到加持以电话录音给她留下的遗言后悲痛欲绝
漏洞：美里不可能一见面就射杀加持；美里没有杀害加持的动机；美里不可能被赋予杀死加持的任务。
观点2：赤木律子
支持：加持良治似乎认识凶手；在某个版本中能听出凶手所穿的是高跟鞋或者皮鞋；律子会用手枪
漏洞：律子不可能一见面就射杀加持；律子是科学家，在那种场合见到律子加持应该感到吃惊；律子没有杀死加持的能力；律子不可能被赋予杀死加持的任务。
观点3：碇元度
支持：加持良治似乎认识凶手；碇元度会用枪；以碇元度的性格会毫不犹豫地开枪
漏洞：作为司令碇元度不可能亲自进行对危险人物的排除行动；碇元度不具备杀死加持的能力
观点4：谍报部二课成员
支持：加持似乎认识凶手；谍报部二课的成员有能力与加持抗衡
漏洞：谍报部二课应该是将加持良治逮捕并且进行审讯而不是当即处决；谍报部二课成员一般不会独个行动
观点5：同时为Seele和Nerv工作的第三方人员
支持：有足够和加持抗衡的能力；由于是被赋予排除任务的人，因此会直接射杀加持
漏洞：无
第2种大观点里各人的看法也不一样，可以说是尚无定论。
我个人倾向是第1种大观点。太过重细梢末支就会本末倒置，迷失原主题思想。
个人观点，看过拉倒。
